Klingt als ware das Projekt auf der Memory Card irgendwie beschädigt. Die verlorenen Remanenzdaten könnten ein Folgefehler sein. Helfen würde wahrscheinlich, die Memory Card zu formattieren (TIA-Portal -> Online & Diagnose) und das Projekt neu zu laden.
Über die Ursache kann man nur spekulieren, wenn man die Vorgeschichte nicht kennt. Hast Du etwas gemacht, was die Projektdaten auf der Memory Card ändert, z.B. Laden, per Programm Startwerte von DBs ändern, ...)? Könnte es vielleicht sein, dass die Memory Card zu voll geworden ist?